분자를 graph로 표현하는 방법 Graph는 node와 edge로 표현되며, node는 vertex(정점)이라고도 말한다. 분자의 독성을 예측할 때, fingerprint 등 다양한 방식으로 표현할 수 있지만 최근에는 Graph로 표현하여 분자의 정보를 더 잘 반영하도록 하는 연구가 활발히 이루어지고 있다. 분자의 원소는 node, 각 원소를 결합하는 방식은 edge로 표현하여 feature를 추출하는 것이다. 일반적으로 분자를 벡터화하는 과정은 아래와 같은 형식으로 이루어진다. 그렇다면 프로그램에서 그래프를 어떻게 나타낼까? 크게 인접 행렬(adjacency matrix)과 인접 리스트(adjacency list)로 나타낼 수 있다. 둘은 각각 그래프의 연결 관계를 2차열 배열과 리스트로 표현한다. ..
